电泳槽根据电泳的原理，凝胶都是放在两个缓冲腔之间，电场通过凝胶连接两个缓冲腔。缓冲液和凝胶之间的接触可以是直接的液体接触，也可以间接通过凝胶条或滤纸条。管状凝胶电泳和垂直板状电泳大多采取直接液体接触方式。这种方式可以有效地使用电场，但在装置设计上有一些困难，如液体泄漏，电安全和操作麻烦等问题。水平板状电泳槽大多通过间接方式，用滤纸桥搭接以及使用缓冲液制作的凝胶条和滤纸条搭接，即半干技术，后种方式使装置简化，操作也大大方便。
电泳槽的常见故障及解决方法：
一、手工粘接电泳槽的铂金电极孔处漏液
该处可能是因为电泳槽工作时间较长所至，对此应使用堵漏胶（稠合液）进行封堵即可。
二、模具水平电泳槽电极孔处漏液
检查电极下的密封圈是否被螺丝拧紧在正确位置或已经损坏。如有损坏需更换密封胶圈。
三、电泳槽有机板粘接处漏液或开胶
有机板开胶此类情况不宜发生，若发现开胶我们可以就地取材使用三氯甲烷进行局部粘接，等胶粘剂凝固后再用堵漏胶粘剂（稠合液）进行封堵即可
四、电泳槽密封条漏液（垂直槽）
一般情况下，电泳槽较窄的密封条不易漏夜，反之较宽的则比较容易漏，此时先检查：
1、密封条是否老化或损坏，若已经老化或损坏，应更换密封条。
2、如果密封条完好无损，目测检查密封条是否有凹凸不平现象，如果有应将密封条拆下进行重新安装。安装时注意不要拉扯密封条，使其自然地嵌入密封槽内，并保证安装均匀，避免密封条出现凹凸现象。
3、如果缓冲液是从密封条的中间漏出，则说明漏处比两边凹（不在同一水平线上），我们则需要把密封条拆下，清理干净槽内胶粘剂，然后再将薄厚相当的窄边条（如0.4毫米）粘在槽内，以垫起凹下的密封条，使其与两边保持一致，此后再将密封条粘在槽内即可。
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